舰船作为核心战斗单位，其性能与定位直接决定了战局走向。游戏内舰船分为护卫舰、驱逐舰、巡洋舰、战列巡洋舰、航空母舰等多个类别，每类舰船均有独特的武器系统与战术价值。部分舰船因出色的火力、生存能力或特殊功能被玩家称为神兵，成为舰队组建的关键选择。
战列巡洋舰作为重型火力单位，凭借高额攻城值与对舰伤害成为攻坚战的绝对主力。新君士坦丁大帝级战巡搭载的轨道炮系统可对大型目标造成毁灭性打击，而太阳鲸级航母则依靠舰载机群实现远程压制，两者在正面战场形成互补。战巡与航母虽强但指挥值消耗巨大，需通过增援功能突破编队限制，同时需搭配护卫舰提供防空掩护。
驱逐舰中的阋神星级因其定制火炮与高闪避特性脱颖而出，前期可通过活动免费获取，造价低廉且机动性极佳，适合作为快速反应部队执行骚扰或支援任务。而护卫舰领域的静海级导弹护卫舰则凭借出色的防空能力成为舰队保护伞，其导弹系统可有效拦截敌机与护航艇，确保主力舰输出环境。
支援型舰船虽不直接参与火力对抗，但作为奶舰的战略价值不可忽视。苔原基础型、卫士支援型等舰船能为友军提供持续修复效果，显著降低战损率。这类舰船通常部署于舰队中后排，需配合装甲型护卫舰抵御突袭。工程舰与运输舰虽非战斗单位，但通过混编采矿、提升仓储容量等操作，可大幅优化资源采集效率，间接支撑军事扩张。
玩家需根据战场需求灵活调配舰船组合，例如对抗高防空敌人时可选用脉冲炮艇无视护甲的特性，而遭遇舰群时则依赖雷利亚特级快速清理护卫舰。舰船强度并非唯一标准，蓝图研究、技术点分配及武器调校同样影响实战表现，需长期投入资源培养。
无尽的拉格朗日的舰船体系强调策略性与平衡性，不存在绝对无敌的单一舰种。合理利用各类神兵的特性，结合地形、同盟协作与战术指挥，方能最大化舰队战斗力，在拉格朗日银河中占据优势。
