搭载护航艇的核心舰船包括航空母舰和部分载机巡洋舰，其中太阳鲸级航空母舰和CV3000级航空母舰是最常见的选择。太阳鲸级基础可搭载6艘护航艇，且具备受损护航艇自动修复功能，而CV3000级则能搭载3艘护航艇和5架大型战机，性价比更高。狩猎级载机巡洋舰作为巡洋舰中的特殊型号，虽然基础型号搭载能力有限，但经过蓝图改造后也能成为护航艇的重要载体。这些舰船的选择需结合玩家资源储备与战术需求。
护航艇的搭载并非单纯追求数量，而是需要根据舰船特性与战场定位进行优化。太阳鲸级更适合作为主力舰队核心，其高载量适合搭配蜂巢守卫者或CV-T800等高性能护航艇；CV3000级则因策略值消耗较低，更适合中小规模战斗或快速反应任务。部分支援型舰船如FSV830快速战术支援舰虽能生产护航艇，但无法直接搭载，需通过自持能力临时补充，这种设计增加了战术灵活性但限制了持续作战能力。
护航艇与载机舰船的协同作战需关注三个关键点：首先是舰船指挥系统对护航艇的调度效率，直接影响战场响应速度；其次是舰船装甲类型与护航艇生存能力的匹配，例如重型装甲舰船更适合搭配高闪避的星云追逐者脉冲型；最后是能源分配问题，搭载过多护航艇可能导致主力武器系统供能不足。这些细节决定了护航艇编组的实际效能，而非简单的数量堆砌。
从技术层面看，护航艇搭载还受限于舰船子系统强化方向。以太阳鲸为例，其蓝图改造后的舰载机协调模块能显著提升护航艇命中率与伤害，而CV3000级的机库扩容技术则可突破基础载量限制。玩家需优先解锁这些关键子系统，否则即便拥有高级舰船也难以发挥护航艇的全部潜力。部分特殊护航艇如虚灵隐身导弹艇对搭载舰船的电子战系统有额外要求，这类隐性条件也需要纳入规划。
在实战部署中，合理的护航艇编组应遵循功能互补原则。防空型护航艇CV-T800需搭配对舰特化的蜂巢守卫者，而具备信息干扰能力的虚灵则适合配合高爆发主力舰。载机舰船本身的站位也会影响护航艇输出效率——后排舰船搭载的护航艇更易存活但输出时机受限，中排舰船则能更快投入战斗但生存压力较大。这种三维空间中的战术博弈，是搭载系统设计最精妙之处。
最终成型的高效编队往往需要数百次战斗数据验证。没有绝对完美的搭载方案，只有最适合当前科技树与敌对环境的临时最优解。玩家应建立动态调整机制，通过战报分析不断优化护航艇种类、载具比例和出击顺序，这才是无尽的拉格朗日深度策略系统的真正魅力所在。
